Text
Identifikasi isolat bakteri lignolitik dengan pendekatan biologi molekular berbasis gen penyandi 16s-rrna
Bakteri lignolitik banyak dimanfaatkan dalam berbagai bidang, seperti proses Biopulping dan Biobleaching dalam industri kertas dan pulp, pembuatan pupuk kompos dalam bidang pertanian, dan degradasi zat warna pada limbah tekstil. Identifikasi isolat bakteri lignolitik dengan pendekatan biologi molekular berbasis gen penyandi 16S-rRNA telah dilakukan pada bulan November 2014 sampai Februari 2015 di Laboratorium Genetika & Bioteknologi dan Laboratorium Mikrobiologi, Jurusan Biologi, Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Universitas Sriwijaya. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui spesies dari isolat bakteri lignolitik dari kawasan Mangrove Taman Nasional Sembilang berdasarkan gen penyandi 16S-rRNA. Tahapan yang digunakan dalam penelitian ini adalah isolasi DNA dengan menggunakan kit Wizard® SV Genomic DNA Purification System (Promega), amplifikasi fragmen gen 16S-rRNA dengan Polymerase Chain Reaction (PCR), elektroforesis, sekuensing melalui jasa komersial First Base, Malaysia dan Macrogen Inc, Korea selatan dan analisis filogenetik melalui program BLAST di situs national centre for biotechnology information (NCBI) dan beberapa program pembuatan pohon filogenetik. Hasil dari penelitian ini adalah diperoleh elektroforegram isolasi DNA, elektroforegram amplifikasi DNA dan analisis filogenetik. Kesimpulan yang diperoleh adalah kode isolat S1SL2 memiliki kemiripan 98% dengan Bacillus pumilus strain L1, S1SL5 memiliki kemiripan 99% dengan Pseudomonas mendocina strain zyj 1-4, S2SL1 memiliki kemiripan 91% dengan Bacillus thuringiensis, S2SL2 memiliki kemiripan 99% dengan Bacillus cereus strain EM7, S3SL2 memiliki kemiripan 86% dengan Bacillus sp. hb13, S3SL3 memiliki kemiripan 88% dengan Bacillus cereus strain DC3, S1TL5 memiliki kemiripan 95% dengan Bacillus cereus strain RR8, S2TL1 memiliki kemiripan 99% dengan Bacillus cereus strain 45-5, dan S3TL1 memiliki kemiripan 99% dengan Bacillus cereus strain L90.
No copy data
No other version available